Alexander V писал(а):
 Могу ли я сейчас написать рапорт на участие в программе ГЖС?  
Рапорт на участие - можете.
 В любое время.  
Пункт 19 Правил  постановления 153, как и п.2  Приказа МО РФ № 215 - 2006 года  не содержат НИКАКИХ ограничений  по периоду подачи  ЭТОГО  рапорта (читайте внимательно - какого!)   
об участии в подпрограмме по форме согласно приложению N 1  
Цитата:
 В этом случае меня внесут в реестр участников программы только на 2012 год (т.к. сроки уже прошли подачи заявлений)? 
Это смотря каких заявлений...
Вас  пока просто признают гражданином -УЧАСТНИКОМ  подпрограммы  и заведут учетное дело (п.3 Приказа 215). 
Применительно к подпрограмме никаких реестров участников не ведется. Списки!
И ни о каком 2012г. пока и речи нет... 
А то, что Вы называете реестром,  на самом деле зовется
 списком  граждан, изъявивших желание получить ГЖС в планируемом году. Планируемый - это - пока 2011 год.. 
Вы не читали п.24 Правил ? Там же  сказано:
Для включения в такой список гражданин - участник подпрограммы в период с 1 января по 1 июля года, предшествующего планируемому, представляет в орган местного самоуправления, в котором находится его учетное дело, заявление о выделении сертификата в планируемом году.
Принятие органом местного самоуправления указанного заявления после 1 июля года, предшествующего планируемому, не допускается.
Если же  его читали члены жилкомиссии части, то от Вас просто не примут  этот рапорт.
И это - РАЗНЫЕ рапорта! Ибо речь в них - о РАЗНЫХ вещах...
Первый подается для включения в число УЧАСТНИКОВ подпрограммы,  а второй - уже  УЧАСТНИКОМ.- для включения в ......  выше написано. 
Цитата:
Таким образом, командир части до момента получения ГЖС не сможет меня исключить из списков части. Я правильно понимаю?
Неправильно. Почему не сможет?! Сможет! Только вопрос законности этого, Вам придется выяснять уже  в суде. 
Однако, и  повод Вы для этого дали сами! Слишком долго думали... 
Если Вас и  признают УЧАСТНИКОМ подпрограммы (тут я не вижу особых препятствий, если Вами будет соблюдена  форма подачи рапорта с необходимыми приложениями), то вот включать Вас в 
список  граждан, изъявивших желание получить ГЖС в планируемом году , как видно из п.24 Правил,  -  никто в 2010 году уже  не обязан. А раз не обязаны, то на данный момент,  ни у кого нет  и  
 ОБЯЗАННОСТИ   ВЫДАВАТЬ Вам   ГЖС в последний год военной службы (абз.3,  п.1,  ст.23 Закона о статусе). А раз не обязаны ВЫДАВАТЬ, то нет препятствий и исключать... 
Вот как то вот так...
Если будет по другому - Вам повезло!